Pemindahan ibu kota ke Kalimantan Timur nantinya akan diurus oleh pejabat setingkat menteri. Menteri Perencanaan Pembangunan Nasional/Kepala Bappenas, Suharso Monoarfa, mengungkapkan nantinya akan dibentuk badan otorita yang bakal mempersiapkan, membangun, hingga finalisasi pemindahan ibu kota.